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Así, los trilobites desaparecieron completamente de los mares, al igual que los placodermos, mientras que otros tipos zoológicos, como las esponjas, los celentéreos y, más tarde, los moluscos y los reptiles, experimentaron a lo largo del mesozoico una extraordinaria diversificación.
El clima fue, durante la mayor parte de la era secundaria, cálido y también húmedo en muchas zonas del globo. Hacia el final de la misma, las temperaturas bajaron de forma generalizada y la atmósfera se hizo más seca. Las masas continentales, agrupadas inicialmente en dos grandes bloques, uno septentrional, correspondiente a Norteamérica y Eurasia, y otro meridional, denominado Gondwana, evolucionaron en el transcurso de la era. De la masa de Gondwana se desprendieron en primer lugar las tierras que conformaron el continente australoindomalgache, separadas del zócalo afrosudamericano. Más tarde, se individualizarían Madagascar, la India y Australia, así como Sudamérica y la mayor parte del actual continente africano. En el norte, Europa se separaría de Norteamérica.
La actividad orogénica, formadora de montañas, fue poco relevante durante gran parte de la era secundaria en Asia y Europa, y predominaron los procesos erosivos y sedimentarios.
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